Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1562641	1562717	77	74 [0]	[0] 35	evgS	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

GAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGAACAAC  >  minE/1562718‑1562779 |                                                              gAATTGATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:839117/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTGATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:854491/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:782106/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:633093/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:690261/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:697209/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:748916/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:751190/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:753919/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:76467/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:774114/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:49002/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:790200/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:906033/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:961389/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:962738/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:972762/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:977817/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:1186684/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:1071296/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:1110273/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:111370/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:1122109/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:1123493/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:1151486/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:1156633/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:1176036/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:1010732/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:225438/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:252263/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:257197/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:287281/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:349566/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:393666/1‑62 (MQ=255) gAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGaacaac  >  1:470625/1‑62 (MQ=255) |                                                              GAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATAGGAACAAC  >  minE/1562718‑1562779

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑