Missing coverage evidence...
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GGCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAATT  >  minE/1687647‑1687708                                                              | ggagcAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:820387/4‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:480098/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:957944/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:917256/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:791589/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:776256/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:762680/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:722325/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:692497/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:692162/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:686068/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:662321/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:602152/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:529206/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:1072010/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:468542/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:464345/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:383313/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:3198/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:294001/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:217508/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:200898/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:193108/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:1188215/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:1178159/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:1102929/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:1098346/1‑62 (MQ=255) ggCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAAtt  >  1:1088142/1‑62 (MQ=255)                                                              | GGCGCAAATGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAGGGATTCGCAATTTGTTGAATT  >  minE/1687647‑1687708

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑