Missing coverage evidence...
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CGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCAG  >  minE/1687899‑1687961 |                                                               cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:541426/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:995729/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:966833/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:938187/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:909605/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:880412/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:753521/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:73778/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:598399/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:557642/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:1000500/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:517126/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:511702/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:458253/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:449734/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:439161/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:383906/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:264514/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:237395/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:146107/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:1178740/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:1117218/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCACTTCCGGTATTGTTCa   >  1:610525/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCCGCC‑CCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCAg  >  1:858269/1‑62 (MQ=255) cGACAGGAAGCCAGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCa   >  1:774212/1‑62 (MQ=255) |                                                               CGACAGGAAGCCCGCCGCCGTGCTCGCGCCTGCCGGATACGCCGCGCTTCCGGTATTGTTCAG  >  minE/1687899‑1687961

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑