Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2254573 2254595 23 81 [0] [0] 77 rpoC RNA polymerase, beta prime subunit

ACGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTC  >  minE/2254512‑2254572
                                                            |
acGACCCAGTACGTGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:3099199/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGTCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:727554/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2775786/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:3212972/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:3117954/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:3100782/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:3099619/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2998516/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2986038/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2889114/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2785329/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:3271457/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2750535/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2625510/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2570652/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2567397/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2503596/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2443996/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2424247/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2284833/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:635848/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:996885/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:947557/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:900485/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:898689/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:872972/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:736682/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:717374/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:705380/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1030397/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:614240/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:554443/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:500080/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:448897/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:43495/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:412812/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:341442/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:3278454/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1236364/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2228636/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1659050/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1658033/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1654705/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1634366/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1600513/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1460278/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1331658/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1259795/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1678367/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1226751/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1217128/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1202413/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1151493/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1143197/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1125733/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1106809/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1065927/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1027235/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2027508/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2164369/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2162561/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2144628/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2124818/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2123186/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2116128/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2093065/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1820996/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1995529/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:199396/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1937790/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1920008/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1918690/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1882130/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1869144/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1849815/61‑1 (MQ=255)
acGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCAATAACCGGAGtc  <  1:497983/61‑1 (MQ=255)
acGACCAAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:1940680/61‑1 (MQ=255)
 cGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2659474/60‑1 (MQ=255)
 cGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:815327/60‑1 (MQ=255)
 cGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:871566/60‑1 (MQ=255)
 cGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGtc  <  1:2360532/60‑1 (MQ=255)
                                                            |
ACGACCCAGTACGCGATCGCGCAGCGGCTCTTTAACGTCACCACCCTCGATAACCGGAGTC  >  minE/2254512‑2254572

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: