Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2254573	2254595	23	81 [0]	[0] 77	rpoC	RNA polymerase, beta prime subunit

ACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAC  >  minE/2254596‑2254657 |                                                              acaATCGTCTTCGGTAACCATCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:147234/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGTGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:837239/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGt                          >  1:688472/1‑38 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCACCCAGAcgacga            >  1:780904/1‑52 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCa                    >  1:2701344/1‑44 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAgac                 >  1:1946977/1‑47 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGCCGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1316922/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGAcgacga            >  1:1772421/1‑52 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:3005936/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:3224530/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2973586/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:284719/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2801106/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2715730/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2690520/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2680378/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2669192/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2592115/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2430994/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2430539/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2384103/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2340888/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2330316/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:630910/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:944836/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:928006/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:888718/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:8629/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:802275/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:775607/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:766081/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:691401/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:3020414/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:524837/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:516011/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:500021/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:398606/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2290332/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:3131183/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:3021181/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:144371/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1827751/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1805762/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1703920/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1686069/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1633970/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:158338/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1515501/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1505149/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1835323/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1340287/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1339350/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1307000/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1291649/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1242591/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1223927/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:121883/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1203718/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2045954/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1004131/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:228417/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2276802/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2185954/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2180308/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2128972/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2096104/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2049789/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2305969/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1975705/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1975093/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1968066/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1908588/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1873640/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1857770/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:1836754/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACAAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:2699489/1‑62 (MQ=255) acaATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACAAGACGACGAGTCAGGTAAc  >  1:3149911/1‑62 (MQ=255) |                                                              ACAATCGTCTTCGGTAACCACCAGGTCCTGCGCCACGTCAACCAGACGACGAGTCAGGTAAC  >  minE/2254596‑2254657

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑