Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2343553 2343617 65 135 [0] [0] 25 glnG fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

Only 100 of 135 total aligned reads displayed.

AGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCA  >  minE/2343493‑2343552
                                                           |
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:3066935/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:398759/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:389689/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:337234/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:3282110/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:32618/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:3258031/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:3230776/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:3213464/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:3132672/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:3122435/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:3104537/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:309758/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:400037/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:3007731/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2945934/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2939947/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2878834/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2867907/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2850585/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2817270/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2803507/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:27333/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1031275/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2694563/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:716835/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:980613/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:961385/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:950549/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:930517/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:913786/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:89676/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:875723/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:87071/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:805621/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:792937/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:753585/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2714408/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:702752/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:688692/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:684207/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:671016/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:665202/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:607106/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:580531/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:543635/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:474479/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:44097/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:402053/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1411125/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1816037/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1745961/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1738833/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1625996/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1601474/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1576974/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1552728/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1548603/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1529781/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1510067/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1490516/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1434475/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1899748/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1334999/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1321476/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1307470/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1288881/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1237690/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1213944/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1197420/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1085094/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1084629/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:107518/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1038918/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2263550/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2632760/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2624784/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2570298/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2541357/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2457174/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2444473/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2415871/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2364659/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2331041/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2665482/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2237908/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2233485/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2226806/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2211441/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2190012/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2137674/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2073128/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2037730/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1951066/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:193944/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCAGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:1050649/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGATGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:3082845/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCGGGAACGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:350962/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCGTATGCCAGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2507031/1‑60 (MQ=255)
aGATATCCATATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCa  >  1:2881031/1‑60 (MQ=255)
                                                           |
AGATATCCGTATGCCGGGAATGGACGGGCTGGCGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCA  >  minE/2343493‑2343552

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑