Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2343553	2343617	65	135 [0]	[0] 25	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

AACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGT  >  minE/2343618‑2343678 |                                                             aacaaTGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:767383/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:3010493/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:988056/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:866551/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:722829/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:506055/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:336879/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:3262426/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:3218941/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:3172000/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:3163545/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:3053260/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:304895/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:1139507/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:295424/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:284658/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:2293288/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:2243207/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:2036794/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:2035989/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:2031703/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:1988947/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:16324/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:1482216/61‑1 (MQ=255) aacaaGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGt  <  1:1194930/61‑1 (MQ=255) |                                                             AACAAGGGGCGTTTGATTATCTGCCCAAACCGTTTGATATCGACGAAGCAGTGGCGCTGGT  >  minE/2343618‑2343678

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑