Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2698464	2698485	22	30 [0]	[0] 22	yrfD	predicted pilus assembly protein

GTTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGGA  >  minE/2698402‑2698463                                                              | gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:2684072/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:980615/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:968953/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:858320/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:827279/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:695692/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:593113/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:532961/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:400843/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:3194883/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:3093553/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:3068024/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:1064910/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:2563766/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:246775/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:2431681/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:237944/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:237773/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:2355576/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:2208484/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:1967951/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:1848743/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:1667441/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:1665640/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:1595098/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:1359048/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:1260693/62‑1 (MQ=255) gtTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGGGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:694032/62‑1 (MQ=255)  ttGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:2842710/61‑1 (MQ=255)  ttGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGga  <  1:2937442/61‑1 (MQ=255)                                                              | GTTGCGATCGTGCGGGGCGCAAAAGAATGCTTTTTGCAACGCTGGTGGCGGTTGCCGCTGGA  >  minE/2698402‑2698463

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑