Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2698464	2698485	22	30 [0]	[0] 22	yrfD	predicted pilus assembly protein

CGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCA  >  minE/2698486‑2698547 |                                                              cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTc               >  1:1825869/1‑49 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGa           >  1:2944856/1‑53 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGc   >  1:2056112/1‑61 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:2520773/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:994521/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:817452/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:807625/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:699238/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:585205/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:3285122/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:2885150/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:279267/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:2627826/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:1019555/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:2362552/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:1962250/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:174872/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:1627432/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:1597879/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:1597777/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:1224271/1‑62 (MQ=255) cGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCa  >  1:1064627/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGGATTGTTGATGCGCAGCAGCTGGCTAAAACGTTGTTACCGTGGAGTCGCGAACTGCCGCA  >  minE/2698486‑2698547

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑