Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1371236	1371240	5	9 [0]	[0] 26	cdd	cytidine/deoxycytidine deaminase

TTCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGCC  >  minE/1371174‑1371235                                                              | ttCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGcc  >  1:1246569/1‑62 (MQ=255) ttCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGcc  >  1:173252/1‑62 (MQ=255) ttCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGcc  >  1:1990720/1‑62 (MQ=255) ttCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGcc  >  1:2057845/1‑62 (MQ=255) ttCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGcc  >  1:2755370/1‑62 (MQ=255) ttCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGcc  >  1:3033350/1‑62 (MQ=255) ttCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGcc  >  1:753253/1‑62 (MQ=255) ttCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGcc  >  1:860791/1‑62 (MQ=255) ttCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGcc  >  1:956142/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTCATGCCGAACAAAGCGCGATCAGCCACGCCTGGTTGAGTGGTGAAAAAGCGCTTGCAGCC  >  minE/1371174‑1371235

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑