Missing coverage evidence...
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CGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTGG  >  minE/1371241‑1371302 |                                                              cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:266514/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:963139/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:951093/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:748461/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:403601/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:345998/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:3246927/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:3024832/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:2980535/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:2916667/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:2863306/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:2818766/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:2676727/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:1032132/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:2618655/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:23403/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:2237683/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:222804/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:2207344/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:1863457/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:1857881/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:1663946/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:1663848/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:1514770/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:1436923/62‑1 (MQ=255) cGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTgg  <  1:1405534/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGTTAACTACACGCCTTGTGGTCACTGCCGTCAGTTTATGAATGAACTGAACAGCGGTCTGG  >  minE/1371241‑1371302

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑