Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1445651	1445727	77	15 [0]	[1] 116	rcsC	hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

CATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAC  >  minE/1445589‑1445650                                                              | cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:1304624/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:167077/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:1805285/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:2320836/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:2345813/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:2509661/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:3147242/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:347383/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:403067/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:715615/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:790586/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:844559/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:953050/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAc  >  1:984918/1‑62 (MQ=255) cATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTACGGCGTTACTCAAc  >  1:2800463/1‑62 (MQ=255)                                                              | CATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTACTCAAC  >  minE/1445589‑1445650

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑