BRESEQ :: Evidence

Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1445651	1445727	77	15 [0]	[1] 116	rcsC	hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

Only 100 of 116 total aligned reads displayed.

ACTGGCACATCCGGTTCAATAAAGCAGTACAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAT > minE/1445699‑1445775

                             cAAGCCTGACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1266795/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTggt  <  1:2624341/48‑3 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTTAt  <  1:626190/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2970978/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:387817/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:335986/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:3272167/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:3249467/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:324412/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:3221055/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:3171674/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:3171658/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:3087043/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:3083026/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:305094/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2995266/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:427357/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2961491/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2949409/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2893312/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:286385/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2859077/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2824124/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2795677/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2786612/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2741674/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2682222/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:724225/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:97447/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:957764/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:94321/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:913138/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:911570/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:90049/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:888585/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:875154/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:751892/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:731844/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:730232/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:406038/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:690857/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:661458/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:647749/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:623411/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:61580/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:597494/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:524319/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:491139/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:48876/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:475287/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2652025/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1468325/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1829598/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1767392/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1752338/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1690662/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1687010/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1685512/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1655478/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1593293/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:156289/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1555267/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1479866/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1474469/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1835172/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:144404/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1420197/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1411965/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1366672/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:132858/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1160701/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1130227/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:109815/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1079479/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:10414/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1021112/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2263140/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1016503/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2587340/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2578905/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2512856/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2449555/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2438880/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2353169/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2303640/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2292902/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2278883/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2272008/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2681102/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2257292/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2228908/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2209505/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2072821/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:205710/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:2023506/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1919206/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1906573/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1884497/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1865136/48‑1 (MQ=255)

                             cAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAt  <  1:1841503/48‑1 (MQ=255)

ACTGGCACATCCGGTTCAATAAAGCAGTACAAGCCTAACTGCTTGCGTACCACCAGCGGTAAATAGTTGGCGGTGAT > minE/1445699‑1445775

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`