Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1557840	1557843	4	23 [0]	[0] 31	emrK	EmrKY‑TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component

TTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTT  >  minE/1557778‑1557839                                                              | ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:2172120/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:947416/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:79351/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:626760/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:515697/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:3189236/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:3097297/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:3052856/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:2889287/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:2829007/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:2590050/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:2230447/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:1087675/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:2101870/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:2082762/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:1820271/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:1781521/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:1421141/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:12027/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:1173966/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:116587/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:1136244/62‑1 (MQ=255) ttGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCttttt  <  1:1097861/62‑1 (MQ=255)                                                              | TTGATTTAGTGATTGCCATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTT  >  minE/1557778‑1557839

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑