Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1557840	1557843	4	23 [0]	[0] 31	emrK	EmrKY‑TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component

CGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGAA  >  minE/1557844‑1557904 |                                                             cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTTGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2189808/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCTTGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2812552/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCAt                  >  1:216494/1‑45 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2607092/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:984068/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:907185/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:769727/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:485570/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:42897/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:303825/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:3033378/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:3014138/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2961104/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:29529/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:280022/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2778516/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:1049270/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2583698/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2531384/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2482472/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2404487/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2090622/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2062619/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:2004123/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:1953118/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:1635707/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:1613472/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:1610344/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGaa  >  1:1101305/1‑61 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGa   >  1:956759/1‑60 (MQ=255) cGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGATGaa  >  1:384582/1‑61 (MQ=255) |                                                             CGGACTGGTATCGATAACTAAAGCCTTACTGGTATAAGCCGGCATGGAGGTCACGGTTGAA  >  minE/1557844‑1557904

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑