Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1840728	1840739	12	33 [0]	[0] 61	truD	pseudoruidine synthase

TCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGT  >  minE/1840666‑1840727                                                              | taaGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:2686163/60‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTGCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:2476604/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTTCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:3074450/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1193585/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:600960/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:467482/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:398676/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:2911677/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:289491/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:2706297/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:251583/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:2456883/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:2439558/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:2280390/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:2087760/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1928672/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1874548/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1855855/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:166217/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1094378/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1386950/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1297237/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1216086/62‑1 (MQ=255) tCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1207986/62‑1 (MQ=255)  cAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCTAGCGCATAAGCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1362831/61‑1 (MQ=255)  cAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:82162/61‑1 (MQ=255)  cAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:541200/61‑1 (MQ=255)  cAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:389966/61‑1 (MQ=255)  cAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1605214/61‑1 (MQ=255)  cAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1642503/61‑1 (MQ=255)  cAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:2186540/61‑1 (MQ=255)            aTTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:3112405/51‑1 (MQ=255)                           aCGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGt  <  1:1214539/36‑1 (MQ=255)                                                              | TCAGATCGGGCATTTCCTTGCCCGGCACGCGAGCGCATAACCACTGTTCCGTAACAGCATGT  >  minE/1840666‑1840727

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑