Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1840728	1840739	12	33 [0]	[0] 61	truD	pseudoruidine synthase

CCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCATC  >  minE/1840740‑1840792 |                                                     ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGc           >  1:868307/1‑44 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGc     >  1:1075603/1‑50 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:3205389/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2443857/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2491265/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2563407/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2605785/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2691233/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2813252/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2814794/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:282451/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2842331/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2868505/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2958139/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:303974/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:3098305/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:3164363/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2354861/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:331191/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:39915/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:452869/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:481026/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:49250/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:493541/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:51099/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:559685/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:587789/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:859979/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:898253/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:916499/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:943477/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1617814/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1105253/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1136104/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1308234/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1319051/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1331591/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:135185/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:135275/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:136723/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:142329/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1446975/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1541145/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1586459/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1594684/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1612025/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2286589/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1636417/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1645378/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:17001/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1705584/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1730274/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1788037/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1801288/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:1956845/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2054295/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2107450/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2112341/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2166694/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCa    >  1:2229094/1‑51 (MQ=255) ccAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCATc  >  1:2647556/1‑53 (MQ=255) |                                                     CCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATGAATTTTCAGGAATTTCGCCAGTGCATC  >  minE/1840740‑1840792

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑