Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2544374	2544438	65	8 [0]	[0] 16	rfaL	O‑antigen ligase

AAACATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCA  >  minE/2544439‑2544499 |                                                             aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTTAGGTTTCa  >  1:3119653/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:1029935/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:1734666/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:1807123/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:2045142/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:2119694/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:2150809/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:2168848/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:2454866/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:2789512/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:2953954/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:3137823/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:3239995/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:471601/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:798326/1‑61 (MQ=255) aaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATGTCAGAGTGTAAGGTTTCa  >  1:1482614/1‑61 (MQ=255) |                                                             AAACATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGTTTCA  >  minE/2544439‑2544499

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑