Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1678138	1678140	3	46 [0]	[0] 27	pbpC	fused transglycosylase and transpeptidase

CCTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAGG  >  minE/1678141‑1678203 |                                                               ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGTTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:1427301/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCa    >  1:1465292/1‑61 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:2508931/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:979844/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:85648/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:689162/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:625899/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:612128/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:560210/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:513583/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:444857/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:3158981/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:2941036/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:2787912/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:2585366/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:2579944/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:2454481/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:220527/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:2125282/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:1899217/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:1889691/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:1649480/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:1596610/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:1427823/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:1234459/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTACCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAg   >  1:2035152/1‑62 (MQ=255) ccTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGG‑GGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAgg  >  1:1130469/1‑62 (MQ=255) |                                                               CCTTCCTGCTCCGGCAGTAATAGAGTTGGCGGCTGACTCCCGTCCAGCAGCCAGGTTGCCAGG  >  minE/1678141‑1678203

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑