Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1742488	1742649	162	23 [0]	[0] 34	rpoE	RNA polymerase, sigma 24 (sigma E) factor

CCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGT  >  minE/1742650‑1742705 |                                                        ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:3679/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:2823175/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:2939533/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:304313/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:3086168/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:3152260/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:3198554/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:3247291/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:3248069/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:2741313/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:463848/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:466400/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:486769/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:50465/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:834452/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:92919/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:992706/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:2101904/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:1192605/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:1233959/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:1289504/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:1363835/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:16993/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:1711689/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:1742186/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:1945051/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:1104894/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:2105566/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:2519617/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:2555960/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:2563890/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:259324/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:2691630/56‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGt  <  1:2705984/56‑1 (MQ=255) |                                                        CCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGT  >  minE/1742650‑1742705

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑