Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	559181	559319	139	10 [0]	[0] 67	cmr	multidrug efflux system protein

TGGCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCA  >  minE/559119‑559180                                                              | tGGCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCa  <  1:117898/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCa  <  1:447215/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCa  <  1:466445/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCa  <  1:471713/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCa  <  1:895315/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCa  <  1:930469/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCa  <  1:954282/62‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCa  <  1:980832/62‑1 (MQ=255)  ggCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCa  <  1:532022/61‑1 (MQ=255)           ggATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCa  <  1:765393/52‑1 (MQ=255)                                                              | TGGCGCTGTGGGATACGCCGCAATTCAGGAATCCTTCGAAGAGGCGGTTTGTATCAAGATCA  >  minE/559119‑559180

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑