Missing coverage evidence...
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ATCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCAA  >  minE/1244012‑1244069                                                          | aTCGCTTCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:567158/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:791393/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:569867/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:584634/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:603966/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:624710/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:627477/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:640545/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:640860/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:648323/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:649492/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:698660/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:746998/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:99820/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:813189/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:830030/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:843887/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:857737/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:891637/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:893473/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:899679/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:957350/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:981305/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:983376/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:162930/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:537897/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:168820/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:188776/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:230826/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:234999/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:241409/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:243690/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:288817/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:309429/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:366742/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:372032/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:397450/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:400029/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:439178/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:440877/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:463752/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:469709/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:472722/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:494016/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:495809/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:502259/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:506751/58‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:558668/58‑1 (MQ=255)  tCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:778440/57‑1 (MQ=255)          aCGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:601905/49‑1 (MQ=255)                  ccATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCaa  <  1:391908/41‑1 (MQ=255)                                                          | ATCGCTGCTACGCCCAGCCATGCTCCCCAGTAGCGCGGGTGGCGAAAGGATTTATCAA  >  minE/1244012‑1244069

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑