Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1317796	1317951	156	22 [0]	[0] 14	cld	regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains

CATCACATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCA  >  minE/1317734‑1317795                                                              | catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:569973/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:994708/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:882045/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:878042/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:834894/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:802673/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:801930/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:796461/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:744727/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:607586/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:597795/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:116850/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:493086/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:472392/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:471119/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:464511/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:463373/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:436363/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:315977/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:278020/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:271119/1‑62 (MQ=255) catcaCATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCcagca  >  1:203783/1‑62 (MQ=255)                                                              | CATCACATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAACTTTTAAGCTTTCGATATCCAGCA  >  minE/1317734‑1317795

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑