Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2380890	2380904	15	38 [0]	[0] 92	rmuC	predicted recombination limiting protein

ACCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCTCAT  >  minE/2380828‑2380889                                                              | aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:599368/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:10001/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:456432/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:462553/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:472145/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:516256/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:527168/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:531348/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:595840/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:596714/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:426051/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:626225/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:67412/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:67862/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:724591/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:779313/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:87336/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:89503/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:951435/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:151642/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:1001006/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:1005929/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:1013321/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:1017466/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:1024519/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:14309/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:39164/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:169627/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:179796/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:185879/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:185981/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:24538/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:308144/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:344218/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:344511/62‑1 (MQ=255)  ccGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:895417/61‑1 (MQ=255)          ttgttCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:11873/53‑1 (MQ=255)            gttCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCtcat  <  1:113242/51‑1 (MQ=255)                                                              | ACCGTCCAGTTGTTCACGTAGCGGCGACAACAGGCTGTTCAGACTCTGACGGTTTTGCTCAT  >  minE/2380828‑2380889

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑