Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2380890 2380904 15 38 [0] [0] 92 rmuC predicted recombination limiting protein

TGTGCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCGCT  >  minE/2380905‑2380955
|                                                  
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAACCTGCTCACTGAGGCgct  <  1:855660/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGctct  <  1:630922/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:709639/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:817438/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:804212/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:799707/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:776763/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:770947/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:766634/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:762289/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:752906/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:720284/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:715/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:821525/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:676859/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:63331/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:630009/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:620494/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:608045/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:60374/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:601852/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:596627/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:587036/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:581703/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:860190/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:984482/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:963698/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:936570/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:930126/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:909562/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:899722/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:899459/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:898924/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:895913/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:881682/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:551587/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:859951/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:85619/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:855502/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:855490/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:852898/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:852758/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:850521/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:84544/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:833474/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:824125/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:172650/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:248603/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:238710/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:225840/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:218192/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:213695/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:202837/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:196808/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:193637/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:187017/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:185707/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:173883/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:259324/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:147878/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:131789/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:121903/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:120870/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:114609/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:103873/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:1036175/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:1026178/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:1023083/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:1004287/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:406916/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:543267/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:538326/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:535273/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:53525/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:526423/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:525455/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:52220/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:479837/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:470100/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:419332/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:414793/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:1002960/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:406331/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:399116/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:365465/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:346147/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:342387/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:316936/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:302123/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:292884/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:278362/51‑1 (MQ=255)
tgtgCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCgct  <  1:261689/51‑1 (MQ=255)
|                                                  
TGTGCTCAAAAATACGGTTGGCGAGGTTTTCAAACTGCTCACTGAGGCGCT  >  minE/2380905‑2380955

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: