Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	825296	825480	185	111 [0]	[0] 48	ychN/ychP	conserved hypothetical protein/predicted invasin

CGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTA  >  minE/825481‑825529 |                                                 cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:694728/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:498724/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:501662/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:507967/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:524277/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:56172/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:575091/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:582222/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:603519/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:641681/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:645149/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:658255/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:485895/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:73487/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:781777/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:859849/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:88260/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:894053/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:917728/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:917844/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:942518/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:947434/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:95307/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:956770/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:241463/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:1015603/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:1051/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:106128/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:111874/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:126706/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:132186/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:134424/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:17904/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:220069/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:230352/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:238537/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:1007260/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:241577/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:256891/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:302859/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:320289/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:339292/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:345806/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:361913/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:36941/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:391058/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:398089/49‑1 (MQ=255) cGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTa  <  1:458266/49‑1 (MQ=255) |                                                 CGCATTATCCCGTTTTATTTACTCTTGCTTGTAGCAGGCGGTACAGCTA  >  minE/825481‑825529

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑