Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2342943	2343175	233	29 [0]	[0] 57	glnL	sensory kinase in two‑component regulatory system with GlnG

TTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGC  >  minE/2343176‑2343229 |                                                      ttACCCGATGGTCAGCGTCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:462727/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:738769/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:494159/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:512304/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:527083/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:557996/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:563173/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:598617/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:599205/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:609792/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:642398/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:648117/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:680526/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:719169/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:737615/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:489739/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:752885/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:782349/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:825664/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:847494/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:864952/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:894246/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:900516/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:916970/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:931937/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:943875/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:971998/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:976999/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:987731/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:38252/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:1018386/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:1028827/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:1037138/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:1037736/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:131224/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:18741/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:187990/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:203373/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:208448/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:279907/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:330609/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:337144/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:353599/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:491460/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:39440/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:412922/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:412971/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:430543/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:431364/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:449293/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:451779/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:462298/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:467486/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:475486/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:47755/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:48102/54‑1 (MQ=255) ttACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGc  <  1:1004512/54‑1 (MQ=255) |                                                      TTACCCGATGGTCAGCGGCCGCGAAGGTGGCACCGGGCTTGGCTTATCCATCGC  >  minE/2343176‑2343229

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑