| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 26935 = | 32 (0.450) | 3 (0.050) | 3/78 | NT | 7.4% | intergenic (+62/‑394) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase |
| ? | minE | 26998 = | 50 (0.910) | intergenic (+125/‑331) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase | |||||
ATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAA > minE/26866‑26992 | atTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCttt > 1:4053009/1‑70 (MQ=255)atTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCttt > 1:2793031/1‑70 (MQ=255)atTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGC‑AAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTaa > 1:689441/1‑71 (MQ=255) tGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAAtt > 1:594926/1‑71 (MQ=255) gcagaaaaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAAtt > 1:2013998‑M1/67‑71 (MQ=255) gcagaaaaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAAtt > 1:3365126‑M1/67‑71 (MQ=255) agaaaaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAAtttt > 1:1045366‑M1/65‑71 (MQ=255) agaaaaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaaaatgTAAtttt < 1:354474‑M1/7‑1 (MQ=255) aaaaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacagaacatgTAAtt > 1:546006‑M1/63‑67 (MQ=255) aaaaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAAt > 1:1895065‑M1/63‑66 (MQ=255) cacaAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGc < 1:3208409/71‑1 (MQ=255) aaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAATTTTTgg < 1:4204718‑M1/10‑1 (MQ=255) aaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAATTTTTgg < 1:41342‑M1/10‑1 (MQ=255) aaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAATTTTTgg < 1:1377873‑M1/10‑1 (MQ=255) aaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAATTTTTgg < 1:4068835‑M1/10‑1 (MQ=255) aaaagtggaccaaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAATTTTTgg < 1:3403992‑M1/10‑1 (MQ=255) acaAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGcc > 1:3560614/1‑71 (MQ=255) tttGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTAt < 1:3069929/70‑1 (MQ=255) tGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTCTGGCCCTTTTAttt < 1:2619058/70‑1 (MQ=255) aaatggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAAtt > 1:2874462‑M1/50‑54 (MQ=255) gTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTAtttt < 1:2047880/70‑1 (MQ=255) tggtcaaaatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAAt > 1:719566‑M1/47‑50 (MQ=255) tGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAAttt < 1:1480606/47‑1 (MQ=255) cAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTAt < 1:296855/70‑1 (MQ=255) cAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTAt < 1:302178/70‑1 (MQ=255) cAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATg > 1:1693700/1‑71 (MQ=255) aatttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAAtttt < 1:2166057‑M1/7‑1 (MQ=255) tttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAAttt < 1:944562‑M1/6‑1 (MQ=255) tttacattaaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAAttt < 1:64570‑M1/6‑1 (MQ=255) aaaaTAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGtt < 1:1404466/71‑1 (MQ=255) taaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAATTTTTgg < 1:4424890‑M1/10‑1 (MQ=255) taaaacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAATTTTTgg < 1:3370240‑M1/10‑1 (MQ=255) acaTTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAAtt < 1:710593/71‑1 (MQ=255) acaTTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAAtt < 1:2453085/71‑1 (MQ=255) acaTTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTG‑TATGTTTTTAAATTg > 1:3750721/1‑71 (MQ=255) aacaacaaaaacagaagacaaaacatgTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGt < 1:1404070‑M1/44‑1 (MQ=255) ttaatttaTTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTg < 1:1620450/49‑1 (MQ=255) taatttaTTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGt > 1:1385843/1‑57 (MQ=255) taatttaTTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGt > 1:431327/1‑57 (MQ=255) taatttaTTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCta > 1:660029/1‑71 (MQ=255) acaaaaacagaagacaaaacatgTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCtat > 1:2437364‑M1/24‑71 (MQ=255) atttaTTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCtata < 1:1771791/71‑1 (MQ=255) atttaTTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTAATTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCtat < 1:3727113/70‑1 (MQ=255) tttaTTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATaa < 1:2871800/71‑1 (MQ=255) aTTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTa > 1:4167106/1‑48 (MQ=255) gATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTgg > 1:62225/1‑40 (MQ=255) aTTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAAt > 1:2057053/1‑55 (MQ=255) aTTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAAt > 1:4358434/1‑55 (MQ=255) aTTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAAt > 1:3016738/1‑55 (MQ=255) ttATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCaaa < 1:2898289/71‑1 (MQ=255) ttATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCaaa < 1:2354137/71‑1 (MQ=255) ttATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCaaa < 1:3656311/71‑1 (MQ=255) ttATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCaaa < 1:2441214/71‑1 (MQ=255) ttATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCaaa < 1:3329628/71‑1 (MQ=255) ttATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCaa > 1:1439155/1‑70 (MQ=255) tataAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCaaa < 1:3777157/70‑1 (MQ=255) acaaaacatgTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGtttt > 1:633502‑M1/11‑46 (MQ=255) gCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGttttt < 1:1306919/41‑1 (MQ=255) cTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGtt < 1:3941794/37‑1 (MQ=255) cTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGtt < 1:1310855/37‑1 (MQ=255) TAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCtat > 1:685477‑M1/1‑48 (MQ=255) | ATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAA > minE/26866‑26992 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |