| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 26935 = | 32 (0.450) | 3 (0.050) | 3/78 | NT | 7.4% | intergenic (+62/‑394) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase |
| ? | minE | 26998 = | 50 (0.910) | intergenic (+125/‑331) | dapB/carA | dihydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase small subunit, glutamine amidotransferase | |||||
AATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGT > minE/26936‑27067 | AATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGtttt > 1:2306427‑M1/1‑70 (MQ=255)AATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTg < 1:4224001‑M1/71‑1 (MQ=255) TTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGt < 1:1767077‑M1/70‑1 (MQ=255) GCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGtc > 1:3478963‑M1/1‑65 (MQ=255) GCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGtc > 1:757157‑M1/1‑65 (MQ=255) GCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGtc > 1:2996930‑M1/1‑65 (MQ=255) CCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGtt > 1:686406‑M1/1‑71 (MQ=255) ccTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGtttt < 1:3931629/60‑1 (MQ=255) ccTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGttt < 1:1513026/71‑1 (MQ=255) cTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACa < 1:2541597/53‑1 (MQ=255) cTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGtttt > 1:2610497/1‑71 (MQ=255) ttttATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGttttt > 1:2134424/1‑71 (MQ=255) ttttATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGttttt > 1:4322846/1‑71 (MQ=255) ttttATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGttttt > 1:1944136/1‑71 (MQ=255) tttATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTttg > 1:3269999/1‑71 (MQ=255) tttATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTttg > 1:2076237/1‑71 (MQ=255) ttATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTttgt > 1:3926869/1‑71 (MQ=255) ttATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTttgt > 1:2230727/1‑71 (MQ=255) atagacaatttaaaaacataacaccaaaaataaaagggccaaaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTttgt > 1:2437364‑M2/49‑71 (MQ=255) tATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGttt > 1:3849010/1‑66 (MQ=255) tATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTttgt > 1:3789333/1‑70 (MQ=255) tATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATAACATGTTTTGTCTTCTGttt > 1:2601619/1‑66 (MQ=255) aTTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTttgttg > 1:3008709/1‑71 (MQ=255) aTTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTttgttg > 1:2152163/1‑71 (MQ=255) ttttGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTtgttgt < 1:2602314/70‑1 (MQ=255) acaatttaaaaacataacaccaaaaataaaagggccaaaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTgttgtt < 1:1404070‑M2/27‑1 (MQ=255) ttGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGtcttct > 1:2838661/1‑57 (MQ=255) ttGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTg > 1:3204665/1‑58 (MQ=255) ttGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGttt < 1:1472988/70‑1 (MQ=255) tGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGtttt < 1:4166404/70‑1 (MQ=255) ggTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTa < 1:152954/70‑1 (MQ=255) aaaacataacaccaaaaataaaagggccaaaaattaCATGTTTTGt > 1:633502‑M2/37‑46 (MQ=255) tATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGtttt < 1:3742984/43‑1 (MQ=255) tATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGtttt < 1:3992855/43‑1 (MQ=255) aTGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTaaa > 1:1915885/1‑71 (MQ=255) tGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGtc < 1:398212/44‑1 (MQ=255) tttttAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGtttt > 1:634832/1‑39 (MQ=255) tttttAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGtttt > 1:3524358/1‑39 (MQ=255) tttttAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGtttt > 1:4301729/1‑39 (MQ=255) tttttAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGtttt > 1:1917956/1‑39 (MQ=255) tttttAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAttt < 1:4060020/71‑1 (MQ=255) tttttAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAttt < 1:2833085/71‑1 (MQ=255) tttttAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAttt < 1:127648/71‑1 (MQ=255) tttAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAtttt < 1:2226147/70‑1 (MQ=255) aaTTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCa < 1:286295/71‑1 (MQ=255) aTTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAtt < 1:3287280/63‑1 (MQ=255) aTTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAtt < 1:187475/63‑1 (MQ=255) ttGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGAcc < 1:536754/68‑1 (MQ=255) ttGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCAtt < 1:1053976/71‑1 (MQ=255) ttGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCAtt < 1:4324431/71‑1 (MQ=255) tGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAtt < 1:3465761/61‑1 (MQ=255) gTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTgttgtt > 1:3091540/1‑48 (MQ=255) gTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTgttgtt > 1:2334194/1‑48 (MQ=255) gTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTgttgtt > 1:2540774/1‑48 (MQ=255) gTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCAttt < 1:938131/70‑1 (MQ=255) gTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCAttt < 1:3785930/70‑1 (MQ=255) tCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAt < 1:1628022/58‑1 (MQ=255) tCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAt < 1:548884/58‑1 (MQ=255) tCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAt < 1:2819412/58‑1 (MQ=255) tCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTgg > 1:3615884/1‑71 (MQ=255) tCTATAAGTGCCAAAAAATACATGTTTTGTCTTCTGTTTttgttg > 1:1808406/1‑45 (MQ=255) taAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGtttt > 1:997905/1‑45 (MQ=255) taAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAttt < 1:2692938/56‑1 (MQ=255) taAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAttt < 1:2053934/56‑1 (MQ=255) taAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAttt < 1:2117803/56‑1 (MQ=255) taAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAt < 1:1276145/54‑1 (MQ=255) aGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTaa > 1:2778338/1‑45 (MQ=255) aGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCAc < 1:4322501/70‑1 (MQ=255) ccaaaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTa < 1:4424890‑M2/30‑1 (MQ=255) ccaaaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTa < 1:3370240‑M2/30‑1 (MQ=255) ccaaaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACtttt < 1:4204718‑M2/60‑1 (MQ=255) ccaaaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACtttt < 1:41342‑M2/60‑1 (MQ=255) ccaaaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACtttt < 1:4068835‑M2/60‑1 (MQ=255) ccaaaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACtttt < 1:3403992‑M2/60‑1 (MQ=255) ccaaaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACtttt < 1:1377873‑M2/60‑1 (MQ=255) aaaattaCATTTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCt < 1:354474‑M2/64‑1 (MQ=255) aaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAAtt < 1:2166057‑M2/39‑1 (MQ=255) aaaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCt > 1:1045366‑M2/8‑71 (MQ=255) aaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTaaa < 1:64570‑M2/37‑1 (MQ=255) aaattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTaaa < 1:944562‑M2/37‑1 (MQ=255) aattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCAttt > 1:2874462‑M2/6‑54 (MQ=255) aattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGc > 1:2013998‑M2/6‑71 (MQ=255) aattaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGc > 1:3365126‑M2/6‑71 (MQ=255) aattaCATGTTCTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACtttttt > 1:546006‑M2/6‑67 (MQ=255) attaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCa > 1:719566‑M2/5‑50 (MQ=255) attaCATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACtttttt > 1:1895065‑M2/5‑66 (MQ=255) cATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGAcc > 1:4422845/1‑45 (MQ=255) cATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGAcc > 1:2578179/1‑45 (MQ=255) cATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCg < 1:3111938/69‑1 (MQ=255) cATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCAGATCgg < 1:2965409/70‑2 (MQ=255) | AATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGTTATGTTTTTAAATTGTCTATAAGTGCCAAAAATTACATGTTTTGTCTTCTGTTTTTGTTGTTTTAATGTAAATTTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGT > minE/26936‑27067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |