| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 205097 = | 26 (0.680) | 54 (1.920) +TTATAACATTTTA |
21/72 | NT | 71.4% | intergenic (+8/‑29) | rnhB/dnaE | ribonuclease HII, degrades RNA of DNA‑RNA hybrids/DNA polymerase III alpha subunit |
| ? | W3110S.gb | 4139149 = | 33 (0.860) | coding (2/1023 nt) | frlB | fructoselysine‑6‑P‑deglycase | |||||
AGACATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < W3110S.gb/205131‑205097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTTATTTTCTCCAGAT > W3110S.gb/4139149‑4139166 ||||||||||||| ggtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:85609/4‑63 gtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTT > 1:1592594/3‑52 tCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:1647173/61‑2 tCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA > 1:2173932/2‑52 tCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT < 1:357487/44‑1 tCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAA < 1:630862/38‑1 tCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTAT < 1:2637969/36‑1 CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtta > 1:3164932/1‑60 CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt > 1:271526/1‑60 CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTC > 1:533193/1‑56 CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT > 1:365533/1‑53 CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA > 1:2651728/1‑51 CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTT < 1:2459557/49‑1 CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAA > 1:1911997/1‑46 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC > 1:945329/1‑57 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCT > 1:835468/1‑56 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:3529287/52‑1 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTT < 1:2504524/49‑1 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATT < 1:2562042/47‑1 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT < 1:369721/46‑1 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAA > 1:111088/1‑37 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCC < 1:3443489/57‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:910449/51‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTT < 1:1403468/48‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTT < 1:744537/48‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTT < 1:937983/48‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT < 1:3301167/42‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAA < 1:3472932/36‑1 CTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtta > 1:2996014/1‑57 CTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtta > 1:2991798/1‑57 CTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT > 1:62758/1‑50 CTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTA < 1:1956089/42‑1 CTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTA < 1:2970381/42‑1 CTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAA > 1:312574/1‑35 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:1842823/58‑3 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:1140045/1‑56 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT > 1:5882/1‑49 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT > 1:3297672/1‑49 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTAT > 1:2234725/1‑48 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA < 1:915009/47‑1 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA > 1:3573182/1‑47 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA > 1:312023/1‑47 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAA > 1:2578474/1‑42 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAA > 1:535733/1‑42 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT < 1:3430438/40‑1 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACA < 1:2282628/36‑1 TCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT > 1:1321627/1‑42 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA > 1:2660579/1‑45 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAA > 1:677451/1‑40 AGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:367519/54‑2 AGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCC > 1:206953/1‑52 AGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT > 1:2117187/1‑40 GATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:2306118/50‑1 GATTCCGGTTTACTTAATCTAGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:1262816/1‑47 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:2365692/53‑3 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:389357/53‑3 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATCTTCTCCAtt < 1:1254093/53‑3 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTAT < 1:684089/43‑1 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAA > 1:621887/1‑37 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAA < 1:3344950/37‑1 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTA < 1:1778285/36‑1 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT < 1:2305094/35‑1 TTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCT < 1:2097270/47‑1 TCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt > 1:926169/1‑49 TCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:324308/1‑49 TCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:2748568/1‑49 TCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:1185511/1‑44 TCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTAT > 1:1445076/1‑41 TCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTT > 1:1828068/1‑38 GGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTT < 1:2204804/35‑1 GTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC > 1:2209517/1‑43 GTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTT < 1:1623782/39‑1 TTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:890386/42‑1 TTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT > 1:1463567/1‑37 TTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:2817345/1‑43 TTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:2779652/1‑38 TACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt > 1:2579794/1‑42 TACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCT > 1:352097/1‑39 CTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:1852743/42‑3 TTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:1895479/40‑2 TTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:323577/37‑1 TAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:114148/1‑38 AATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:367295/1‑37 AATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC > 1:732734/1‑35 AATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC > 1:119168/1‑35 ||||||||||||| AGACATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < W3110S.gb/205131‑205097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTTATTTTCTCCAGAT > W3110S.gb/4139149‑4139166 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |