New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? W3110S.gb 205097 =26 (0.680)54 (1.920)
+TTATAACATTTTA
21/72 NT 71.4% intergenic (+8/‑29) rnhB/dnaE ribonuclease HII, degrades RNA of DNA‑RNA hybrids/DNA polymerase III alpha subunit
?W3110S.gb 4139149 = 33 (0.860)coding (2/1023 nt) frlB fructoselysine‑6‑P‑deglycase

AGACATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  W3110S.gb/205131‑205097
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                                   |||||||||||||                  
AGACATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  W3110S.gb/205131‑205097
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTTATTTTCTCCAGAT  >  W3110S.gb/4139149‑4139166

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.