Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4091238	4091249	12	27 [0]	[0] 30	malQ	4‑alpha‑glucanotransferase

GAGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGC  >  W3110S.gb/4091173‑4091237                                                                 | gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1191340/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:865477/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:811368/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:785330/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:542265/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:525114/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:516904/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:492134/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:477400/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:430690/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:2475503/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:2471655/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:2307567/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:2152518/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1922987/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1922045/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1868467/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1724155/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1682387/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1601389/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1236838/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1229713/65‑1 (MQ=255) gaGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1003585/65‑1 (MQ=255)  aGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:1586057/64‑1 (MQ=255)  aGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:616770/64‑1 (MQ=255)   gCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:819447/63‑1 (MQ=255)                  tCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGc  <  1:987156/48‑1 (MQ=255)                                                                 | GAGCAGATGGCCGCGTTTCGCCAGTTTGTTGCAGAGCAGGGCGACAGCCTGTTCTGGCAGGCAGC  >  W3110S.gb/4091173‑4091237

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑