Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4091238	4091249	12	27 [0]	[0] 30	malQ	4‑alpha‑glucanotransferase

ACATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGTAT  >  W3110S.gb/4091250‑4091313 |                                                                aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGGCAGAGATGt    >  1:267167/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGGCAGAGATGt    >  1:2497260/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATg     >  1:1014451/1‑61 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:235322/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:984619/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:899011/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:835927/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:790611/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:586178/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:519439/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:507392/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:300918/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:27508/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:2502932/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:2250963/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:2145715/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:194695/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:1894584/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:1725275/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:1448970/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:1428471/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:1395988/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:139138/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:1271227/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:1115790/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:1077279/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:1043966/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGt    >  1:1028267/1‑62 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGTAt  >  1:2492660/1‑64 (MQ=255) aCATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGACAGAGATg     >  1:283576/1‑61 (MQ=255) |                                                                ACATGCCCAGCAAGTGAAAGAGGACGAAATGCGCTGGGGCTGGCCTGCATGGCCAGAGATGTAT  >  W3110S.gb/4091250‑4091313

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑