Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1048537	1048560	24	15 [0]	[0] 33	ymcB	conserved hypothetical protein

AGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAG  >  W3110S.gb/1048472‑1048536                                                                 | aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:1382009/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:1512086/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:1680009/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:1950639/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:1993235/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:2141148/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:2270416/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:246719/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:2493892/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:2522961/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:294071/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:621082/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:930179/65‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCGCACCCTCAg  <  1:1169558/65‑1 (MQ=255)  ggCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAg  <  1:2067617/64‑1 (MQ=255)                                                                 | AGGCGGTGGTTCCACATGTCTTTTATTCCACAGGGCAACAGGGGCGACGACAGTCTCACCCTCAG  >  W3110S.gb/1048472‑1048536

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑