Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1048537	1048560	24	15 [0]	[0] 33	ymcB	conserved hypothetical protein

TGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCA  >  W3110S.gb/1048561‑1048624 |                                                                tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTCACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:494232/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:711265/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:2432816/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:2440508/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:301038/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:319277/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:370551/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:599440/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:65079/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:2401988/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:730534/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:731262/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:7638/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:769980/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:808148/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:808254/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:966011/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:1021618/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:2352975/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:2348267/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:2284739/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:2215672/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:2043490/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:2017911/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:200744/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:1886006/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:1771450/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:1704525/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:1553312/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:1404820/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:1208315/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:114206/64‑1 (MQ=255) tGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGAAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCa  <  1:1821168/64‑1 (MQ=255) |                                                                TGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCA  >  W3110S.gb/1048561‑1048624

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑