Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1131091	1131118	28	14 [1]	[0] 9	flgN	export chaperone for FlgK and FlgL

TAGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGCCTGTT  >  W3110S.gb/1131051‑1131094                                        |     taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:1178679/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:1207252/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:1215265/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:133897/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:1642784/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:184593/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:2225491/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:229651/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:481712/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:671859/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:748830/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:762428/40‑1 (MQ=255) taGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGcc      <  1:922790/40‑1 (MQ=255)     gTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGCCTGtt  >  1:1015367/1‑40 (MQ=255)                                        |     TAGCGTCGGTTCCTGATGCGGTTTCAACATTTCCAGCGCCTGTT  >  W3110S.gb/1131051‑1131094

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑