Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1593759	1593781	23	17 [0]	[0] 24	hipA	regulator with hipB

GTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAG  >  W3110S.gb/1593695‑1593758                                                                | gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:2151562/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:83131/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:8308/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:730128/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:644642/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:452104/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:360106/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:2277193/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:1118091/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:1961004/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:1909649/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:166538/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:1255273/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:1237857/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:1137039/64‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:1120778/64‑1 (MQ=255)  tAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAg  <  1:2319767/63‑1 (MQ=255)                                                                | GTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAATACGGCATCAGAGGTGATATTCCCCCTCTGCAATGGCAG  >  W3110S.gb/1593695‑1593758

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑