Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1593759	1593781	23	17 [0]	[0] 24	hipA	regulator with hipB

AACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAC  >  W3110S.gb/1593782‑1593846 |                                                                 aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTgc                          >  1:190237/1‑41 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:2145803/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:833103/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:829073/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:796569/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:708433/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:629527/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:60194/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:545389/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:486552/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:308026/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:277098/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:2277434/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:1038222/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:2088946/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:1817290/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:1807857/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:177290/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:1595868/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:1477776/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:1300964/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:1211921/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:1112299/1‑65 (MQ=255) aaCGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAc  >  1:1059344/1‑65 (MQ=255) |                                                                 AACGGCTTGCTAACCACTCCGGTGCATACTTAAAGGTGTGCGCGCCGTTGGCTAACTTCGTTAAC  >  W3110S.gb/1593782‑1593846

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑