Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2007271	2007310	40	20 [3]	[0] 25	fliD	flagellar filament capping protein

CAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGC  >  W3110S.gb/2007207‑2007286                                                                |                 cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:234233/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:920612/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:851228/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:623259/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:381054/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:318741/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:1030927/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:2329090/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:2173053/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:2057782/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:194259/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:1917696/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:1652630/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:1569755/64‑1 (MQ=255) cAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:1244161/64‑1 (MQ=255) cAACGGCCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:1656057/64‑1 (MQ=255)  aaCGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGa                  <  1:740565/63‑1 (MQ=255)                aaGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGc  >  1:470447/1‑65 (MQ=255)                aaGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGc  >  1:824619/1‑65 (MQ=255)                aaGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGc  >  1:865403/1‑65 (MQ=255)                                                                |                 CAACGGGCATTATTAAAGCCGCTACCGATGGCGTTAGTAAGACCCTGAATAAATTAACTAAAGACTACAACGCCGCCAGC  >  W3110S.gb/2007207‑2007286

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑