Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2007271	2007310	40	20 [3]	[0] 25	fliD	flagellar filament capping protein

CGCTACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTA  >  W3110S.gb/2007311‑2007375 |                                                                 cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:2244386/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:989061/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:958355/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:886475/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:742060/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:577254/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:438945/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:419556/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:413527/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:338997/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:309620/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:226589/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:2249846/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:1082480/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:1977344/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:1835279/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:1517528/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:1389275/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:136832/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:1359869/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:1265742/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:1247183/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:1194518/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:109337/1‑65 (MQ=255) cgctACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTa  >  1:1092753/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CGCTACAAAGAACAATTTACCCAACTGGACGTTTTAATGACCTCGTTAAACAGCACCAGCAGCTA  >  W3110S.gb/2007311‑2007375

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑