Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1964893	1964903	11	34 [0]	[0] 30	flhA	predicted flagellar export pore protein

CCAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAT  >  W3110S.gb/1964904‑1964967 |                                                                ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTAt            >  1:986015/1‑54 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCaa   >  1:1106973/1‑63 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCaa   >  1:272212/1‑63 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCaa   >  1:2403727/1‑63 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:99380/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1043056/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:833166/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:629743/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:587580/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:48157/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:474945/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:474278/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:247820/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:2307486/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:2304621/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:2200197/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:2185064/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:204138/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1792516/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1785604/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1759613/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1639584/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1637264/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1397433/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1341718/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1319171/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1214005/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1185716/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1179518/1‑64 (MQ=255) ccAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAt  >  1:1108416/1‑64 (MQ=255) |                                                                CCAGTCCTCCCCCGCCCTGCAGCGCCTGTAGTAACAAACGTTCCAGCGGTGTATCGAGGCCAAT  >  W3110S.gb/1964904‑1964967

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑