Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1965591	1965609	19	27 [0]	[0] 26	flhA	predicted flagellar export pore protein

GCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCATT  >  W3110S.gb/1965610‑1965673 |                                                                gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGTATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:2395226/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAAccc           >  1:2130920/1‑55 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAAcc            >  1:854183/1‑54 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:1164970/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:986279/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:909443/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:86257/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:620205/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:556117/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:455121/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:395525/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:2496837/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:2262200/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:2230930/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:2096758/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:196933/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:192293/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:1839903/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:1411414/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:1374218/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:1252861/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:1176790/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCAtt  >  1:1146112/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACACACTTCCAtt  >  1:924373/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATAGGGATCAGACGATAACCCACATCCAtt  >  1:2283069/1‑64 (MQ=255) gCCCAACAACACACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCCtt  >  1:39171/1‑64 (MQ=255) |                                                                GCCCAACAACTCACCATCCTGCTGGAAATCGACCATCGGGATCAGTCGATAACCCACTTCCATT  >  W3110S.gb/1965610‑1965673

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑