Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3290949	3291143	195	44 [0]	[0] 48	yraJ	predicted outer membrane protein

ACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTC  >  W3110S.gb/3290884‑3290948                                                                 | aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:627442/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1016646/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:306700/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:345405/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:363344/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:417594/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:430487/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:481844/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:494499/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:538361/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:601586/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:261000/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:631617/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:730615/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:754043/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:798742/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:850536/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:878033/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:902790/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:970217/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:98175/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:99896/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1577697/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1175530/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1164639/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1392093/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1397786/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1399996/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1128548/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:214801/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1488413/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1578289/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1590655/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1677308/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1682149/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1695808/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:179491/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1049385/65‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGCAATCGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1090712/65‑1 (MQ=255)  cAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1469980/64‑1 (MQ=255)  cAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1643543/64‑1 (MQ=255)          cAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:877251/56‑1 (MQ=255)           aaTGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:202727/55‑1 (MQ=255)                            tCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTc  <  1:1434541/38‑1 (MQ=255)                                                                 | ACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTATCGCGTACTTGTTACAGTC  >  W3110S.gb/3290884‑3290948

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑