Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3786684	3786785	102	47 [0]	[0] 45	emrD/ivbL	multidrug efflux system protein/ilvB operon leader peptide

AGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAG  >  W3110S.gb/3786619‑3786683                                                                 | aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:603977/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:209152/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:217381/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:252169/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:311025/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:329303/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:418814/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:430296/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:450615/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:479455/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:533770/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:5717/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:202486/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:61234/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:622542/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:677421/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:730664/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:778095/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:782627/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:978676/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:979979/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:987928/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:990014/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1439085/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1018887/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1021734/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:102383/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1034149/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1077151/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1144191/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1166971/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1272596/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1369507/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:142917/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1016414/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1527856/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:154549/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1608800/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1636513/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1660416/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1703744/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1754324/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1779423/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1814144/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:1832401/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAg  >  1:189656/1‑65 (MQ=255) aGCGGCAGAATAAGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGCAGGGCGGATAAg  >  1:937944/1‑65 (MQ=255)                                                                 | AGCGGCAGAATATGTAAACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAG  >  W3110S.gb/3786619‑3786683

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑