Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4001372	4001507	136	17 [0]	[0] 34	pitA	phosphate transporter, low‑affinity

CCGCCGGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGT  >  W3110S.gb/4001307‑4001371                                                                 | ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:27331/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:817756/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:692581/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:607578/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:566357/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:541900/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:382147/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:361545/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:327864/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:1022123/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:1808254/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:178769/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:1684994/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:1489784/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:1412975/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:1181416/1‑65 (MQ=255) ccgccgGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGt  >  1:1121630/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CCGCCGGAAAGCAGTACCGCAGCCGGAAGGGTAAACACCCAGGCCATCAGAATGCTGGTCACGGT  >  W3110S.gb/4001307‑4001371

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑