Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4039979	4040028	50	24 [0]	[0] 22	rpoH	RNA polymerase, sigma 32 (sigma H) factor

CCCGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGAA  >  W3110S.gb/4039915‑4039978                                                                | cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGCTCCACGaa  >  1:1390081/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:197747/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:975551/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:900037/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:898231/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:823335/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:80399/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:778435/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:748515/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:680557/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:679833/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:663107/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:231314/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:1017192/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:1885196/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:1602768/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:1493765/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:1439069/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:136062/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:1295283/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:1223672/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:1221509/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:1182179/1‑64 (MQ=255) cccGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGaa  >  1:1060695/1‑64 (MQ=255)                                                                | CCCGGAAGTGGGTGTGCGCCTGGTCTCCTTCGCCGTTCACTGGATCAAAGCAGAGATCCACGAA  >  W3110S.gb/4039915‑4039978

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑