Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4444799	4444852	54	89 [0]	[0] 96	ytfL	predicted inner membrane protein

AAACATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCA  >  W3110S.gb/4444734‑4444798                                                                 | aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:190768/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:427571/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:400031/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:375338/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:356402/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:296060/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:251173/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:224258/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:222139/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:19839/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:196101/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:428770/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1880499/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1797080/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1771312/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1770721/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1726907/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1697568/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1671535/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:164570/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1642267/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1002922/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:706405/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:997052/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:963022/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:947191/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:879882/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:792046/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:777753/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:776355/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:774068/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:750627/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:739537/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1624010/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:695568/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:688482/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:641189/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:63546/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:632388/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:585986/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:538810/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:519426/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:483676/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1111402/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1255677/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1246813/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1220565/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1215929/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1207979/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1188720/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1176182/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1172758/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1120216/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1621182/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1108084/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1101351/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1071976/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1068634/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1055343/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:104333/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1040562/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1017176/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:101498/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1269636/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1621705/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1602468/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1572819/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1565426/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1508174/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1482280/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1444250/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1442734/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1441092/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1422798/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1420878/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1405472/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1377581/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1300067/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1283821/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1274600/65‑1 (MQ=255) aaaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1263853/65‑1 (MQ=255)  aaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1128247/64‑1 (MQ=255)  aaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1047942/64‑1 (MQ=255)  aaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:803474/64‑1 (MQ=255)  aaCATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1024866/64‑1 (MQ=255)             gccgccGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:677750/53‑1 (MQ=255)               cgccgATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1377957/51‑1 (MQ=255)                  cgATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1871113/48‑1 (MQ=255)                            gTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCa  <  1:1226892/38‑1 (MQ=255)                                                                 | AAACATCATAAAGCCGCCGATGGTTTCGTAGTTGCCCGACTGCGGGAACTCGTCAATATCCAGCA  >  W3110S.gb/4444734‑4444798

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑