Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	559258	559275	18	17 [0]	[0] 67	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

AATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGG  >  W3110S.gb/559193‑559257                                                                 | aaTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:1075385/65‑1 (MQ=255) aaTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:773895/65‑1 (MQ=255) aaTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:53875/65‑1 (MQ=255) aaTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:1586281/65‑1 (MQ=255) aaTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:456939/65‑1 (MQ=255) aaTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:1857734/65‑1 (MQ=255) aaTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:281101/65‑1 (MQ=255) aaTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:297218/65‑1 (MQ=255) aaTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:379588/65‑1 (MQ=255)  aTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:976901/64‑1 (MQ=255)  aTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:385932/64‑1 (MQ=255)  aTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:361308/64‑1 (MQ=255)  aTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:1765540/64‑1 (MQ=255)  aTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:1587318/64‑1 (MQ=255)  aTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:1364254/64‑1 (MQ=255)  aTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:1194009/64‑1 (MQ=255)  aTACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTgg  <  1:1165818/64‑1 (MQ=255)                                                                 | AATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGG  >  W3110S.gb/559193‑559257

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑