Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 569245 569401 157 54 [0] [0] 173 ybcK predicted recombinase

ATCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTA  >  W3110S.gb/569181‑569244
                                                               |
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCATTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:819346/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:639484/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:217927/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:259868/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:33033/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:333082/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:339786/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:351209/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:38247/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:413435/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:449228/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:524525/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:580503/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:586904/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:622266/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:191666/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:687431/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:703429/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:719476/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:765103/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:783678/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:80405/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:838885/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:877205/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:961075/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:979607/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:983721/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1586728/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1036152/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1113474/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1181868/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1222319/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1321595/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1350117/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1361245/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1365988/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:13747/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1397832/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1515274/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:100134/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:15934/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1605448/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1651127/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:165639/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1665679/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1714383/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1766923/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1788687/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:179488/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1798069/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1860484/64‑1 (MQ=255)
atCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1861782/64‑1 (MQ=255)
 tCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1447061/63‑1 (MQ=255)
 tCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTa  <  1:1363129/63‑1 (MQ=255)
                                                               |
ATCATTAATGAATTGCTTTTTAATTGTAGCAAAATTCAACCAGTTGAAAACAAGAAAGATGCTA  >  W3110S.gb/569181‑569244

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: