Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 569245 569401 157 54 [0] [0] 173 ybcK predicted recombinase

Only 100 of 173 total aligned reads displayed.

GAGTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGA  >  W3110S.gb/569402‑569465
|                                                               
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTTTTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:241964/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:349526/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:599728/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:561307/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:540165/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:515245/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:507479/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:477325/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:468865/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:426890/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:423505/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:396974/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:375250/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:353103/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:60020/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:338597/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:315489/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:305007/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:292526/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:273841/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:261931/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:249984/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:229770/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:218543/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:21624/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:799245/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:966182/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:945405/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:937029/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:932446/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:928332/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:921445/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:90493/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:871411/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:841656/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:832859/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:822657/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:803363/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:19991/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:794052/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:792783/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:768992/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:742850/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:726900/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:72408/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:714158/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:693541/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:674760/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:664597/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:63918/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1195928/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1405436/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1363208/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1342929/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1323973/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:131918/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1302234/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1296753/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1267136/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1251427/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1233416/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1227636/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:121565/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1447121/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1180741/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1174857/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1144888/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1107070/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1101167/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1086661/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1079129/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:106374/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1059182/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1027249/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:10155/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1643193/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1881612/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1854207/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1836318/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1820547/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:181056/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1809149/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1780202/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1719524/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1705057/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1699895/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1692333/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1651840/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1001428/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:161727/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1604669/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1596102/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1588554/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1551847/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1544331/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:153593/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1532594/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1523358/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1522396/64‑1 (MQ=255)
gagTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACga  <  1:1474818/64‑1 (MQ=255)
|                                                               
GAGTAAAGGTGTAAATTCATTCAGTGATTTTTATGCTATTGACTTAACCAGTAAAAATGGACGA  >  W3110S.gb/569402‑569465

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑