Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1041755	1041759	5	69 [0]	[0] 49	appA	phosphoanhydride phosphorylase

TCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCT  >  W3110S.gb/1041690‑1041754                                                                 | tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTGATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1865060/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGTGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1740352/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:279214/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:6589/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:615042/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:483072/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:476372/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:441361/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:435128/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:400358/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:388511/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:673194/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:238065/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:217855/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1875308/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1867593/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1831699/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1771452/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:857845/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:947081/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:938687/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:932037/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:92849/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:914077/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:909430/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:892561/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:875883/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1769411/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:844159/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:764844/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:748579/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:725894/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:723324/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:704713/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:70033/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1383796/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1046303/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1057865/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1118858/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1156262/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1213220/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1236547/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1238889/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1308528/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1331798/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:133905/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1343414/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1355599/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1375051/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1377524/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1010709/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:158056/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1767117/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1760327/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1663327/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1659733/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1642892/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1619237/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1612775/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1385677/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1570359/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:153503/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1509579/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1465495/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1422221/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1403909/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCt  >  1:1399619/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAAAGCt  >  1:853316/1‑65 (MQ=255) tCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGAATCAATGCt  >  1:1133967/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TCGGAACTCAAGGTGAGCGCCGACAATGTCTCATTAACCGGTGCGGTAAGCCTCGCATCAATGCT  >  W3110S.gb/1041690‑1041754

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑